Karę naliczono według ministerstwa za opóźnienia w poszczególnych etapach realizacji umowy w sierpniu i grudniu 2014 r.

Resort poinformował, że zgodnie z pierwotnym harmonogramem pierwsze wersje Scentralizowanego Systemu Poboru, Centrum Rozliczeń i Systemu Zarządzania Dokumentacją o ograniczonym zakresie funkcjonalności miały zostać odebrane w 2014 r. Natomiast wdrożone je w urzędach skarbowych w grudniu 2015 r.

Ministerstwo poinformowało, że zgodnie z aneksem z 30 września 2015 r. wprowadzono zmiany dotyczące terminów realizacji tzw. Architektur Pośrednich w ramach systemu e-Podatki: termin realizacji TA3 przełożono z 31 maja 2015 r. na 19 października 2015 r. Według resortu odbiór nastąpił z dniem 30 grudnia 2015 r. 

Łączna wysokość kar dla Sygnity związanych z realizacją umowy e-Podatki naliczona przez resort wynosi ponad 5,1 mln zł. Umowę na budowę, wdrożenie i utrzymanie systemu zawarto w lutym 2013 r. Zgodnie z ubiegłorocznym aneksem wynagrodzenie Sygnity z tytułu realizacji umowy może sięgnąć kwoty 230,4 mln zł.